研究报告/Research Report

苹果UV-B受体基因UVR8的克隆及生物信息学分析  

丁文展1 , 张高龙1 , 樊连梅1 , 刘更森1 , 隋秀奇2 , 原永兵1
1青岛市现代农业质量与安全工程重点实验室,青岛,266109;
2烟台现代果业科学研究所,烟台,264680
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 15 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001779
收稿日期: 2015年04月03日    接受日期: 2015年05月08日    发表日期: 2015年06月23日
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推荐引用:

Ding W.Z., Zhang G.L., Fan L.M., Liu G.S., Sui X.Q., and Yuan Y.B., 2015, Cloning and bioinformatics analysis of UV-B receptor gene UVR8 in apple (Malus domestica Borhkcv. Fuji), Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(8): 1779-1785 (丁文展, 张高龙, 樊连梅, 刘更森, 隋秀奇, 原永兵, 2015, 苹果UV-B受体基因UVR8的克隆及生物信息学分析, 分子植物育种, 13(8): 1779-1785)

摘要

本研究以‘富士’苹果红色芽变品种‘烟富8’果皮为试验材料,采用RT-PCR方法,克隆获得苹果UV-B受体基因UVR8的全长序列,命名为MdUVR8。结果显示,开放阅读框长度为1 359 bp,编码452个氨基酸,相对分子质量48.487 kD,等电点(PI)为5.56。蛋白质保守域分析表明,苹果UVR8蛋白包含7个RCC1结构域。蛋白质二级结构预测显示,苹果UVR8蛋白含有10个α-螺旋,16个β折叠,41个β-转角。氨基酸同源性比对分析表明,苹果UVR8与已报道的其他植物的氨基酸序列相似性在69.54%~88.94%之间。核苷酸聚类分析表明,苹果和白梨首先聚为一类,其次是梅。本研究为苹果光受体对光应答的分子机理的进一步研究奠定了基础。

关键词
‘富士’苹果;UV-B受体;MdUVR8;同源克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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